全書分四部分。首述子午流注療法的定義、淵源及其發展、特點及治療原理、適用範圍和禁忌證、療程等;次論釋和論證十二時辰氣血走注歌訣及穴位分說;再錄頭頸、上肢、胸腹、腰背、下肢一百六十六種常用配穴,並介紹內、婦、兒、外、五官等科一百六十餘種疾病的穴位配伍方法。末錄十二則典型病例。